武汉2019冠状病毒基因组的生物信息学分析
南开大学生命科学学院东部战区总医院英国诺丁汉特伦特大学生物科学系南开大学医学院南开大学数学科学学院
摘要：2019年12月，中国武汉报道了冠状病毒引起的肺炎，其临床症状与2003年爆发的严重急性呼吸综合征（Severe Acute Respiratory Syndrome, SARS）不同，因此推断该病毒可能是冠状病毒的一个新变种。不同于简单使用全基因组序列的其它研究，我们于2018年在国际上首次提出分子功能与进化分析相结合的研究思想，并应用于冠状病毒基因组的研究。在这一思想指导下，本研究使用beta冠状病毒基因组中的一个互补回文序列（命名为Nankai complemented palindrome）与其所在的编码区（命名为NankaiCDS）对新发布的武汉2019冠状病毒基因组（GenBank:MN908947）进行分析以期准确溯源，并对beta冠状病毒的跨物种传播和宿主适应性进行初步研究。溯源分析的结果支持武汉2019冠状病毒源自中华菊头蝠，但与SARS冠状病毒差异巨大，这一结果与两者临床症状差异一致。本研究的最重要发现是beta冠状病毒存在大量的可变翻译，从分子水平揭示了该病毒变异快、多样性高的特点，为beta冠状病毒的防控提供了依据。从beta冠状病毒可变翻译中获取的信息可应用于（但不限于）其快速检测、基因分型、疫苗开发以及药物设计。另外，我们推断beta冠状病毒可能通过可变翻译以适应不同宿主。本研究是基于大量基因组数据的实证分析，在国际上首次从分子水平尝试解释了beta冠状病毒变异快、宿主多且具有较强的宿主适应性的原因。 还原
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